综述目前临床上结核枝杆菌特异基因检测方法有哪些?各有何特点?

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综述目前临床上结核枝杆菌特异基因检测方法有哪些?各有何特点?

主要包括:常规PCR、REAL-TIME PCR、链替代扩增技术(SDA)、核酸分子杂交、DNA测序及基因芯片技术等方法。(1)常规PCR由于容易发生交叉感染及非特异性扩增,会导致检验结果假阳性。另一个方面,如果样本前处理和DNA抽提方法不当等原因,又会导致假阴性的产生。(2)REAL-TIME PCR灵敏度高,同时结合荧光探针杂交,特异性好,方便快捷,因此目前实时荧光定量PCR技术是最常用的TB分子检测方法。(3)链替代扩增技术(SDA)是一种基于酶促反应的DNA体外等温扩增技术,采用SDA技术检测结核杆菌时,以IS6110和16SRNA基因为扩增靶点,方法特异性较好。(4)线性探针杂交法(LPA)利用生物素标记的引物,特异性扩增TB的靶序列,将标记有生物素的扩增产物与固定在薄膜检测条上的特异性寡核苷酸探针反向杂交,加入标记有碱性磷酸酶的链霉亲和素,与杂交物上的生物素结合,最后加入显色底物,检测结核杆菌。(5)焦磷酸测序是一种新型的酶联级联测序技术,非常适合于已知短序列的序列分析,其重复性和准确性均较好,而且速度较双脱氧测序法大大提高。焦磷酸测序能对大量样本实现低成本、适时、快速、直观的单核苷酸多态性研究,广泛用于微生物的鉴定分型等。(6)基因芯片技术检测具有高通量的优势,可以实现对TB分类鉴定及耐药基因的快速检测,但由于检测成本较高及仪器设备昂贵限制了其临床应用。(7)GENEXPERT全自动结核杆菌检测技术是一种全自动核酸扩增与检测技术,该方法以半巢式荧光定量PCR技术为基础,能够直接从病人痰液中同时检测TB以及利福平耐药基因,整个检测过程自动化,时间不超过2小时。被认为是目前最先进的一种检测TB及其耐药性的方法。

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