分析上级主管部门否定建设单位指定A公司承包该工程的理由。
机电工程项目按《招标投标法》及《招标投标法实施条例》规定，凡在中华人民共和国境内进行下列机电工程建设项目，包括项目的勘察、设计、施工以及与机电工程项目有关的重要设备、材料等的采购，必须进行招标。一般包括：
（1）大型基础设施、公用事业等关系社会公共利益、公共安全的项目；
（2）全部或者部分使用国有资金投资或国家融资的项目；
（3）使用国际组织或者外国政府贷款、援助资金的项目。
本工程由政府和一家民营企业共同投资兴建，属于全部或者部分使用国有资金投资或国家融资的项目，必须进行招标。包括项目的勘察、设计、施工以及与机电工程项目有关的重要设备、材料等的采购，必须进行招标。
