综述HBV基因分型方法有哪些?各有何特点?

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综述HBV基因分型方法有哪些?各有何特点?

目前对HBV进行基因分型的方法主要有:SBT法、PCR–RFLP法、线性探针反向杂交法(LIPA)、基因型特异性引物PCR法(PCR–SSP)和基因芯片技术。①PCR–SSP法是根据不同HBV基因型存在的差异序列设计一系列特异性引物。PCR扩增后可得到不同长度的片段,以此进行分型。该方法操作简单,但对引物设计要求高。②PCR–RFLP法是目前常用的基因分型方法,通过PCR扩增出不同基因型的目标片段,此片段通常为S基因或前S基因。扩增产物用3~5种特定的限制酶进行酶切,将酶切图谱与数据库进行比较,从而确定基因型。RFLP敏感性高,但酶切位点易受基因变异影响,且对混合感染或酶切不完全者,可能出现复杂条带,影响分型结果判断。③线性探针反向杂交法是通过设计HBV不同基因型的型特异性探针,利用PCR及反向点杂交技术,将生物素或荧光素标记的扩增产物与尼龙膜上的特异型探针进行反向点杂交,通过酶联显色或荧光扫描信号来判断HBV的基因型。该方法操作较为简便,结果准确,可以检出混合基因型的存在,比SBT具有更高的优越性。④基因芯片技术是近年来发展起来的新技术,将HBV型特异性探针点样到玻片上,直接与荧光标记的PCR扩增产物杂交,通过荧光扫描来判断结果。如在某一种型特异性探针之处出现荧光,即可确定HBV属于这一基因类型。⑤SBT法是利用特异性引物扩增HBV基因组多个区域,通过联合多区域的测序结果绘制进化树,从而获得序列信息。该方法结果可靠、获取信息多,可以发现新基因。但操作繁琐、费用昂贵,不适于临床大量标本检测。

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