综述如何设计高质量的实时荧光定量PCR引物。

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综述如何设计高质量的实时荧光定量PCR引物。

设计引物时应注意①在实时荧光PCR中,单链引物的最适 长度为15〜20BP,GC含量在20%〜80%(45%〜55%最佳)。②TAQMAN引物的TM值最好 应在68〜70°C,分子信标和杂交探针相关引物的TM值变化区间可大一些,但对于同一对 引物而言,其TM值应接近,差异不要超过2°C。③为了尽量减少在PCR反应过程中非特异 扩增,引物的3’端最好不为G和(或)C。引物3#端的5个碱基不应出现2个G和(或)C。 如果用SYBR GREEN I方法,所用的PCR引物应尽量避免形成明显的引物二聚体。④扩增 片段的长度根据所釆用的技术不同有所区别:SYBR GREEN' I技术通常要求扩增片段不大于300BP, TAQMAN探针技术要求扩增片段应在50〜150BP,不能超过400BP。

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