试论述如何提高杂交技术的杂交信号检测效率?

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试论述如何提高杂交技术的杂交信号检测效率?

需综合考虑以下因素:①选择探针:根据不同杂交实验要求,选择不同的核酸探针。检测单个碱基改变选用寡核苷酸探针;检测单链选用与其互补的DNA单链探针、RNA探针或寡核苷酸探针;检测复杂的靶核苷酸序列和病原体选用特异性强的长的双链DNA探针;原位杂交选用寡核苷酸探针和短的PCR标记探针。②探针的标记方法:考虑实验的要求,如灵敏度和显示方法,检测单拷贝基因序列时,选用标记效率高,显示灵敏的探针标记方法。对灵敏度要求不高时,选用保存时间长的探针标记方法。③探针的浓度:一般来说,探针浓度增加,杂交率也增加,但过高会增加背景颜色。最佳原则是应用与靶核苷酸探针达到最大结合度的最低探针浓度。④杂交率:杂交初始速度依赖于探针的长度和浓度。⑤杂交温度:在杂交速率最大的温度条件下进行杂交反应,RNA:DNA杂交温度为TM值下10-15℃,DNA:DNA杂交温度为TM值下10-15℃。⑥杂交的严格性:通过调节盐浓度、甲酰胺浓度和杂交温度来控制所需严格性。⑦杂交反应时间:探针浓度、探针复杂性以及杂交体积,所含甲醛情况均可影响杂交时间。⑧杂交促进剂:惰性多聚体可增加杂交速率。

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